Eu também não encontrei, mas creio que os produtos nucleares só por acaso estarão relacionados com o termo. Trata-se, portanto, de um neologismo, que só pode significar o contrário de comissionar, logo, o seu antónimo.

Dado que comissionar quer dizer «encarregar alguém de um serviço», tal como o francês commissionner, descomissionar será, pois, «suspender alguém de um encargo».

Para as centrais nucleares julgo que o verbo usado para indicar a sua saída de funcionamento é desactivar.