A grafia correcta é com ss, como em psicossomático. Acho preferível chamar a higio- elemento de formação de palavras, tal como hidr(o), por exemplo.

Prefixo é mais uma partícula, sem existência própria, mesmo antigamente (isto é, no latim ou no grego). Ora higio- e hidr(o)- vêm de termos que já havia em grego, com o significado respectivo de «sadio» e de «água».