Ao substantivo feminino vantagem pode seguir-se a preposição de ou em, indicando diferença de posição ou situação de algo ou alguém em relação a outros ou a si mesmo num momento anterior, conforme os exemplos:

«O João tem vantagem em ser membro da Academia: tem descontos em todas as lojas de desporto.»

«O João tem a vantagem de ser membro da Academia.»

«A vantagem de dormir cedo é descansar mais.»

Penso que a diferença ao optar pela preposição de ou em será a presença do artigo definido a antes do substantivo vantagem, ou seja, teremos de ter a presença da combinatória a vantagem de.