O Acordo Ortográfico de 1990 (AO 90) mantém o hífen, nas palavras formadas com o prefixo contra-, quando a palavra-base começa por h ou a. Assim, as palavras em causa passam a grafar-se contraordenação e contraordenacional (cf. Vocabulário Ortográfico da Língua Portuguesa da Porto Editora e Vocabulário Ortográfico do Português).
Em Portugal, onde por enquanto ainda se aceita o Acordo Ortográfico de 1945, a par do AO 90, por causa de um período de transição, pode escrever-se também contra-ordenação e contra-ordenacional.
