Recomendo a forma fotótipo*, porque o elemento de composição -tipo não deve (ou não deveria) receber acento tónico. Isto não impede que no uso ocorram oscilações como logótipo e logotipo, ou protótipo e prototipo. O mesmo acontece com fotótipo, que ocorre frequentemente como fototipo, sobretudo em referência a tipos de pele. No entanto, a respeito deste caso, lembro que a posição do Ciberdúvidas tem sido aconselhar a opção pela forma logótipo (ver Textos Relacionados), e, por isso, também me parece preferível fotótipo.

* A palavra tem dois significados: «reprodução fototipográfica» (cf. fototipiar ou fototipar, no dicionário da Porto Editora, na Infopédia); «tipo de pele em função da coloração e sensibilidade à luz solar» (exemplo: «... um factor de proteção solar adequado ao vosso fotótipo...», exemplo citado pelo Dicionário Priberam da Língua Portuguesa).