Hidrofóbico, de acordo com o Dicionário Eletrônico Houaiss, é adjectivo «relativo a hidrofobia» e, como termo da área da química, «diz-se de substância que não absorve ou adsorve água». Por outro lado, hidrófobo [adjectivo e substantivo masculino], segundo o mesmo dicionário, é «que ou aquele que sofre de hidrofobia ('raiva')» e, em sentido figurado, «que ou aquele que se apresenta enfurecido, irado; possesso».
Assim, respondendo directamente à sua pergunta, e já que cromatografia é o «processo através do qual moléculas presentes em misturas complexas podem ser separadas com base nas suas solubilidades em diferentes solventes e em suas mobilidades em diferentes substratos», só poderá ser cromatografia hidrofóbica.