É infra-estruturas, segundo a ortografia vigente em Portugal, porque o elemento infra- (= posição inferior) se liga por hífen ao elemento seguinte, quando este tem vida própria e começa por vogal, h, r ou s.

N.E. — Com a aplicação do Acordo Ortográfico de 1990, e segundo a Base XVI, o prefixo infra- (e todos os prefixos ou elementos prefixais com o mesmo contexto ortográfico, isto é, terminados na letra a-) passou aglutinar-se sempre com o elemento seguinte, sem hífen, excepto se este começar por a (ex.: infra-assinado) ou h (ex.: infra-humano). No caso de o elemento seguinte começar por r ou s, essas consoantes devem ser dobradas (ex.: infrarrenal, infrassom). Portanto: infraestrutura, segundo o Acordo Ortográfico de 1990.