Para explicar a etimologia de Aguncheiras parece que deve ter-se em mente o nome Agunchos, que parece ter o mesmo radical. É que propõe A. de Almeida Fernandes, em Toponímia Portuguesa: Exame a Um Dicionário (Arouca, Associação para a Defesa da Cultura Arouquense, 1999):
«É claro que Agunchos se deve ao n. comum "aguncho", derivado de "água" + suf. uncho (< lat. -unculu-): topónimo, pois, devido a pequenas correntes de água ou pequenas nascentes; o que pode hoje estar alterado. Quanto a Aguincho, é o mesmo, isto é, Aguncho, com a alteração do timbre, por -úin-, antes da palatal -ch-, com aparente avanço do acento tónico. Aguincheira é, pois, um simples derivado de Agúincho ou Agúincha (ou mesmo de Aguncho ou Aguncha).»1
Pela minha parte, parafraseando Fernandes, diria então que Aguncheira é simples derivado de "aguncho", «pequena torrente, nascente».
Cabe no entanto observar que, na Galiza, ocorre, nas províncias de Pontevedra e da Corunha, o topónimo Aguiúncho, que Fernando Cabeza Quiles, em Os Nomes de Lugar (Vigo, Edicións Xerais de Galicia, 1992, pág. 497), faz derivar do latim aquila, «águia». Dada a semelhança de Aguiúncho com Aguincho e o facto de este com Aguncho serem variantes do mesmo termo, cabe também sugerir outra hipóteses: os nomes Aguincheiras e Aguncheiras podem estar relacionados com aquila, mediante formas portuguesas correspondentes ao galego Aguiúncho, este pressupondo uma forma hipotética como *aquilunculu, «pequena águia». Sendo assim, Aguncheira seria etimologicamente o mesmo que "lugar onde existem pequenas águias, isto é, aves de rapina».
Não tendo elementos que me permitam decidir entre a hipótese de Fernandes e a que julgo poder formular-se a partir de Cabeza Quiles, deixo aqui registo das duas.
1 José Pedro Machado (Dicionário Onomástico Etimológico da Língua Portuguesa) acolhe o nome Agunchos, para lhe atribuir origem obscura e rebater como improvável uma hipótese do filólogo J. M. Piel, segundo a qual Agunchos se relacionaria com Gonça e Gunça. No entanto, Machado não chega a propor uma etimologia como faz Fernandes (op. cit.).
