Em nome do  Ciberdúvidas, agradeço as suas amáveis palavras. Remeto a sua sugestão para os coordenadores editoriais deste sítio.

Não conheço normas para a apresentação das entradas (ou lemas) dos vocábulos que constituem um glossário ou um dicionário. O Dicionário Houaiss, o da Academia das Ciências de Lisboa e o Dicionário Verbo de Língua Portuguesa usam minúsculas, desde que não se trate de nomes próprios (que, aliás, só raramente aparecem neste tipo de obras; é nas enciclopédias que os encontramos). Já no Dicionário Unesp do Português Contemporâneo (brasileiro), os lemas estão em maiúsculas; e no Grande Dicionário da Língua Portuguesa de José Pedro Machado a entrada tem inicial maiúscula.

Pessoalmente, acho preferível usar sempre minúsculas, porque é nessa forma que as palavras aparecem no meio da frase, e a acentuação gráfica fica mais clara. Note-se, aliás, que os dicionários escolares ingleses e franceses também usam as minúsculas.