De acordo com a generalidade dos instrumentos linguísticos consultados (ex.: dicionários Priberam, Infopédia e Aulete Digital), o x da palavra látex deverá ser pronunciado como [ks]. 

No que diz respeito à delimitação dos contextos em que a referida pronúncia é aceitável, penso que esta resposta de Carlos Rocha será suficientemente elucidativo, sobretudo a nota de rodapé nele contida.