O Dicionário da Língua Portuguesa 2008, da Porto Editora, regista o verbo provisionar («do lat[im] provisiōne-, "previdência; precaução" + -ar»), mas remete-nos para aprovisionar, a forma preferível.
Aprovisionar significa «munir de provisões; abastecer; prover» e «fazer provisões».
Assim, no contexto em causa, é «A conta depósitos à ordem do cliente deverá estar aprovisionada, caso contrário a ordem será recusada», ou seja, «... deverá estar munida de fundos (dinheiro)...».