Neste caso, de acordo com a regra geral, o verbo com sujeito composto vai para o plural e o particípio para o masculino plural ¹. Deste modo, a frase (1) respeita esta regra:

(1) «As obras e seu respetivo valor haviam de ser avaliados.»

No entanto, numa situação em que o núcleo da frase seja apenas o constituinte «As obras», sendo o constituinte «e o seu respetivo valor» tomado como parentético, o verbo vai para o plural e o particípio para o feminino plural, concordando com o sujeito «As obras». No contexto desta possibilidade, julgamos, todavia, que o constituinte parentético deveria surgir entre vírgulas para desfazer a ambiguidade que pode gerar com a interpretação presente em (1):  

(2) ««As obras, e seu respetivo valor, haviam de ser avaliadas.»

Em nome do Ciberdúvidas, agradeço as suas gentis palavras.

Disponha sempre!

1. cf. Cunha e Cintra, Nova Gramática do Português Contemporâneo. Ed. Sá da Costa, pp. 494 e ss.