As dúvidas que apresenta levam-me a pensar não ter sido muito clara. Espero conseguir sê-lo agora.

1. Está correcta a frase “Eles vão superar-se a si mesmos.”, mas não, “Eles vão superar a si mesmos.” O verbo está conjugado reflexamente (superar-se) e admite, como reforço da forma átona do pronome (se), o emprego da sua forma tónica preposicionada (a si), constituindo um complemento directo pleonástico.

2. Está errada a frase “Eles vão superar eles mesmos.”, mas está correcta esta outra: “Eles vão superar as dificuldades, eles mesmos.” O pronome “ele” não preposicionado não é usado como complemento directo (dirá Evanildo Bechara, como qualquer outro gramático – é matéria consensual), pelo que a primeira destas duas frases está errada. Mas o mesmo não acontece com a segunda frase, em que o emprego de “eles mesmos” não é mais do que uma forma de realçar o sujeito, repetindo-o. Não se trata do complemento directo, mas do sujeito “eles”, repetido, ligado ao adjectivo “mesmo”, que significa que é o próprio, mencionado, dito, referido.