O animal em referência parece ser do género feminino, mas não é impossível que seja do sexo masculino. Os contextos situacional e discursivo é que ajudarão a desambiguar a frase.

Cria é um nome sobrecomum, isto é, usa-se como substantivo a que se atribui apenas um género gramatical (neste caso, o feminino), embora podendo referir-se a indivíduos tanto do sexo masculino como do feminino. Se necessário for, como a palavra se aplica sobretudo a animais, o substantivo cria comporta-se como um epiceno, associando-se a macho e fêmea para explicitar o sexo do indivíduo designado: cria macho, cria fêmea (outras opções morfológicas e ortográfica, aqui). Protagonista é um nome comum de dois, ou seja, é um nome que apresenta a mesma forma para os dois sexos, ficando o género marcado no artigo, determinante ou adjetivo que se lhe associem: «o protagonista», «a portagonista».

Se cria se referir a um indivíduo do sexo masculino, é de esperar que protagonista assuma o género masculino: «O protagonista é uma cria de esquilo-vermelho, que estava mais interessada...» (também aceitável «interessado» se se pretender ter «o protagonista» por antecedente). No entanto, não se deve excluir o caso em que protagonista adota o género feminino por simples concordância gramatical, porque cria é sempre do género feminino. Se for esta a situação, não é possível saber ao certo qual o sexo do animal em referência, a não ser que se recorra ao contexto situacional ou discursivo.