Escreve-se aminoglicosídeos. O termo é formado de amino- (elemento de formação de palavras que exprime a ideia de amina) + glicosídeos  (heteróxidos derivados da glicose). Amina, por sua vez, é o nome genérico dado a qualquer composto orgânico cuja fórmula possa ser obtida da do amoníaco, substituindo um ou mais átomos de hidrogénio por igual número de alquilos ou acilos.

Note-se que glicosídeos é forma mais usada no Brasil, porque em Portugal se prefere glicósidos. Sendo assim, parece que a forma mais adequada em português seria "aminoglicosídeos". Contudo, o uso do termo entre médicos e que está atestado no Dicionário Médico de A. Manuila et alii (Lisboa, Climepsi Editores) é aminoglicosídeos.