De facto, é sabido que a pronúncia dos termos médicos é por vezes diferente em Coimbra e Lisboa. Mas o que interessa é o que está nos vocabulários e dicionários que se baseiam na ortografia oficial, que ainda é a de 1945. O legal e o mais correcto é glicemia, leucemia, etc. (à semelhança de anemia); enzima (nunca ouvi doutro modo); síndrome ou síndroma (esdrúxulos e femininos). Desconheço polimérase, embora haja vários compostos esdrúxulos terminados no mesmo sufixo de origem grega.

Não há propriamente regras, mas geralmente a etimologia é que manda. Quase sempre tais compostos assentam no grego e obedecem à acentuação que teriam (ou têm) se viessem através do latim. Por vezes, porém, são neologismos recebidos através do francês, e então não podem, em princípio, ser esdrúxulos, dado que nesta língua não há palavras proparoxítonas.